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項目經(jīng)歷(案例一)
項目時間:2009-01到2016-03
項目名稱:轉(zhuǎn)基因生物新品種培育科技重大專項
項目描述:
項目介紹
課題總體目標(biāo):
克隆大豆胞囊線蟲的致死基因,通過體外RNAi鑒定這些基因的功能。運用轉(zhuǎn)基因技術(shù)在大豆根中表達上述候選基因的dsRNA,驗證植物介導(dǎo)的RNAi對大豆胞囊線蟲的致死作用。獲得具有自主知識產(chǎn)權(quán)的控制大豆胞囊線蟲的相關(guān)基因和方法。為培育大豆抗胞囊線蟲種質(zhì)提供新基因和新方法。
研究內(nèi)容:
1. 以秀麗線蟲的致死基因為參照標(biāo)準,克隆大豆胞囊線蟲的同源致死候選基因。
2. 建立體外大豆胞囊線蟲的RNAi技術(shù)體系,驗證所克隆的上述候選基因的功能。
3. 通過轉(zhuǎn)基因技術(shù),在大豆根系中表達上述候選基因的dsRNA,研究植物表達的dsRNA對大豆胞囊線蟲體內(nèi)相應(yīng)基因的下調(diào)作用及致死作用。
4. 進一步檢測轉(zhuǎn)基因根系喂食的胞囊線蟲中目的基因的表達特征,以確認所用方法的可靠性。
我接手本項目需承擔(dān)的工作
1.大豆胞囊線蟲的分離純化、鑒定、培養(yǎng)。
2.胞囊線蟲對轉(zhuǎn)基因大豆根系的侵染研究。
3.檢測根系對線蟲的抗性。
我的職責(zé)
接手項目合作伙伴的前期工作,繼續(xù)完成項目包含的內(nèi)容。
主要發(fā)表的文章:發(fā)根農(nóng)桿菌介導(dǎo)不同基因型大豆轉(zhuǎn)化效率的篩選.河南農(nóng)業(yè)科學(xué),2012
專利:
1.一種大豆胞囊線蟲抗性鑒定方法。專利編號:201110125396
2.大豆胞囊線蟲RNA解旋酶CGH-1及其編碼基因與應(yīng)用。CN201110317555.5
項目經(jīng)歷(案例二)
項目時間:2013-07到2016-03
項目名稱:國家自然科學(xué)基金項目子課題——獼猴桃種質(zhì)基因組遺傳多樣性及種間親緣關(guān)系研究
項目描述:
項目介紹
本項目主要 1)從EST序列和基因組測序數(shù)據(jù)中大規(guī)模開發(fā)SNP分子標(biāo)記,在獼猴桃資源庫中的代表性種質(zhì)中對部分SNP進行高通量分型驗證,用于獼猴桃種質(zhì)的遺傳評價;2)同時開發(fā)品種/物種特有SNP標(biāo)記,用于獼猴桃種質(zhì)的分子鑒定。
最終,1)得到了100多個SNP標(biāo)記,很好地解析了所用種質(zhì)遺傳背景,指導(dǎo)種質(zhì)開發(fā)利用和核心種質(zhì)庫構(gòu)建;2)開發(fā)得到一批獼猴桃屬物種及品種特異SNP標(biāo)記用于品種鑒定;研究結(jié)果兼具重要的理論和應(yīng)用價值。
我的職責(zé)
全程負責(zé)實驗操作及數(shù)據(jù)分析工作:1.大量閱讀文獻,了解研究背景,發(fā)現(xiàn)問題并確定研究課題;2.明確研究方法,對生物信息學(xué)開發(fā)得到的SNP標(biāo)記進行篩選,用MassARRAY DNA質(zhì)譜儀進行SNP分型驗證。對分型數(shù)據(jù)進行分析應(yīng)用于獼猴桃種質(zhì)資源評價,并開發(fā)獼猴桃物種或品種特有SNP用于種質(zhì)的分子鑒定;3.論文撰寫;
項目經(jīng)歷(案例三)
項目時間:2011-01到2016-03
項目名稱:北京市農(nóng)林科學(xué)院科技創(chuàng)新專項 “生防種質(zhì)資源庫建設(shè)與綜合利用” (KJCX201101001)
項目描述:
項目介紹
研究目標(biāo)
1.通過對中國特殊生境地區(qū)土壤采集,分別進行樣品分離,培養(yǎng),篩選,保存等工作,初步對土壤細菌、真菌、放線菌、酵母菌等微生物進行分離保存。
2.通過對初步篩選的土壤微生物進行多種病原菌抑菌譜測定,明確不同土壤微生物對應(yīng)不同靶標(biāo)病害,為明確土壤微生物對靶標(biāo)病害的生防機制提供依據(jù)。
3.采用16SrDNA ITSrDNA基因序列初步鑒定具有生防作用的土壤微生物,同時根據(jù)菌株形態(tài)特征,生理生化特性、碳源利用等指標(biāo),進一步鑒定菌株分類,為鑒定微生物新種質(zhì)資源及具有生防機制菌株奠定基礎(chǔ)。
主要研究內(nèi)容:
1.菌株的分離及保存:將西藏、貴州、青海等特殊生境地區(qū)采集的土壤樣品,進行稱樣,加水,搖晃培養(yǎng),按一定稀釋倍數(shù)分別涂布于PDA、馬丁、牛肉膏蛋白胨、YPD等培養(yǎng)基,進行放線菌、真菌、細菌、酵母菌的分離培養(yǎng),挑選及保存工作。
2.菌株的抑菌譜測定:將挑選出來的各類菌株分別對葡萄炭疽、黃瓜枯萎、番茄灰霉等病原菌進行對峙培養(yǎng),挑選具有生防作用的微生物菌株。
3.菌株的種類鑒定:將具有生防作用的真菌進行ITS序列鑒定,細菌及放線菌進行16S鑒定,初步明確微生物種屬。結(jié)合形態(tài)特征,生理生化特性及碳源利用等指標(biāo)進一步鑒定生防微生物。
我的職責(zé)
項目的參與者之一,主要負責(zé)從中國特殊生境西藏、貴州、青海地區(qū)采集土樣,負責(zé)土壤細菌、真菌、放線菌等微生物的分離,培養(yǎng),篩選,保存,及部分菌株的鑒定工作。
發(fā)表的文章:一株生防細菌的分離鑒定及其抑菌活性物質(zhì)的分析.中國農(nóng)學(xué)通報,2012
項目經(jīng)歷(案例四)
項目時間:2014-01到2016-03
項目名稱:北京市農(nóng)林科學(xué)院青年科研基金
項目描述:
項目介紹
研究目標(biāo)
(1)通過對多粘類芽孢桿菌抗生素產(chǎn)物分離鑒定及高效液相色譜法檢測,明確不同來源的兩株多粘類芽孢桿菌Fusaricidins 類型,建立Fusaricidins檢測體系。
(2)通過對Fusaricidins提取物進行多種病原菌抑菌譜測定,確定主要靶標(biāo)病害,為其生防產(chǎn)品的開發(fā)和登記試驗提供依據(jù)。
(3)優(yōu)化Fusaricidins 類抗生素發(fā)酵工藝,放大到5L、30L發(fā)酵罐,為提高產(chǎn)品質(zhì)量、降低生產(chǎn)成本奠定基礎(chǔ)。
主要研究內(nèi)容:
(1)Fusaricidins 類抗生素分離鑒定:將兩株多粘類芽孢桿菌發(fā)酵液經(jīng)酸化加熱離心萃取,通過層析、高效液相色譜法分離純化并檢測Fusaricidins,確定其類型及濃度。
(2)Fusaricidins 類抗生素生物活性驗證:以甘藍枯萎病、番茄灰霉病、黃瓜枯萎病等多種病害為靶標(biāo),進行抑菌譜的檢測及盆栽試驗防治效果驗證。
(3)Fusaricidins 類抗生素發(fā)酵工藝研究:發(fā)酵培養(yǎng)基及發(fā)酵參數(shù)的優(yōu)化,建立高產(chǎn)發(fā)酵工藝,并進行不同體積發(fā)酵罐放大驗證。
我的職責(zé)
項目的執(zhí)行者
主要發(fā)表的文章:Expression of Paenibacillus polymyxa -1,3-1,4-glucanase in Streptomyces lydicus A01 improves its biocontrol effect against Botrytis cinerea. Biological Control,2015
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